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Affymetrix芯片服務平台

Affymetrix GeneChip生物芯片检测系统, 是由高密度GeneChip芯片和试剂, 杂交、扫描仪器,数据处理和分析工具组成的一整套检测平台, 是世界上第一种经欧盟和美国FDA审批的可用作体外诊断的芯片系统。

Affymetrix芯片技術特點:

Affymetrix 芯片服務平台一览:

 

一、基因組層次研究服務: 

 Affymetrix SNP分型芯片服務

芯片名稱

芯片信息

Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array 6.0

该芯片涵盖超过1,800,000个遗传变异标志物:包括超过906,600个SNP和超过946,000个用于检测拷贝数变化(CNV,Copy Number Variation)的探针

Affymetrix Mouse Diversity Genotyping Array

这款芯片与Human SNP 6.0 芯片类似,既包含SNP探针,也包含CNV探针。一共涵盖623,124个SNP位点和916,269个CNV探针。

Affymetrix GeneChip Rice 44K SNP Genotyping Array

芯片覆盖indica, aus, tropical japonica, temperate japonica, and group V (“aromatic”)多个水稻亚种的44,1000个SNP。 每10kb至少包括1个SNP,每个SNP设计12个探针技术重复相关系数R2 > 99%。

二、轉錄組層次研究服務: 

 Affymetrix基因表達譜芯片服務

芯片名稱

芯片信息

Affymetrix GeneChip® Human Genome U133 Plus 2.0 Array

该芯片包含了47,000个转录本,代表了38,500个明晰的人类基因。数据库来源于GeneBank、dbEST、RefSeq、UniGene database、Washington University EST trace repository、NCBI human genome assembly。

Affymetrix GeneChip Human Transcriptome Array 2.0

最高分辨率的基因芯片,支持所有轉錄本異構體的全轉錄組分析,包含超過六百萬條不同探針,覆蓋編碼和非編碼轉錄本。

该芯片为每个外显子设计约10条探针,每个外显子之间的剪接点有4条探针,确保每个实验都能获得完整、准确和可重复的数据。重复性高(批内相关系数≥0.99),所有检测过的组织观察到的变异系数(CV)<6.5%。样品类型既包括新鲜冻存样品,也包括FFPE 样本。

Affymetrix GeneChip Human Gene 2.0ST Array

Affymetrix新一代全转录本芯片,在一张芯片上可以同时检测mRNA和lincRNA, 与上一代1.0 ST Array相比,2.0 ST Array有更多的优点:全面覆盖转录组,可以同時檢測>30,000個編碼的轉錄本和>11,000個長鏈非編碼轉錄本;探針設計最大程度覆蓋所有外顯子,可檢測選擇性拼接/轉錄本變體。每個轉錄本覆蓋特異探針的數目中值達到21種,每種探針的長度爲25bp,這意味著每個轉錄本將被檢測的堿基數中值高達525個;重複性高;靈敏度高。

Affymetrix GeneChip Mouse Gene 2.0 ST Array(

Affymetrix新一代全转录本芯片,在一张芯片上可以同时检测mRNA和lincRNA, 与上一代1.0 ST Array相比,2.0 ST Array有更多的优点:全面覆盖转录组,可以同时检测35,240个编码的转录本和>2,000个lincRNA;探针设计最大程度覆盖所有外显子;重复性高;灵敏度高。

Affymetrix GeneChip Mouse Genome 430 2.0 Array

该芯片涵盖了39,000个转录本,代表34,000个明晰的小鼠基因。序列信息基于GeneBank、dbEST、RefSeq、UniGene database。 

Affymetrix GeneChip Rat Genome 230 2.0 Array

该芯片包含有31,000个probe sets,代表28,000个明晰的大鼠基因。序列信息基于GenBank , dbEST, RefSeq等权威数据库。 

 Affymetrix miRNA芯片服務

芯片名稱

芯片信息

Affymetrix miRNA 4.0 Arrary

100% 覆盖miRBase v20数据库,同时检测203个物种的miRNA,信息量大-芯片结果包括:host gene ID、miRNA target genes、clustered miRNA等

Affymetrix miRNA 3.0 Arrary

含蓋Sanger miRBase V17.0數據庫,同時檢測153個物種的miRNA,同時檢測成熟miRNA和miRNA前體,能檢測人snoRNA和scaRNA

技術支持

電話:021-57072092
Email:service6@sangon.com