香港马报

网 站
反 馈
网 站
指 南

聯系生工

有任何問題,請聯系技術部門或銷售辦事處

聯系技術 聯系銷售

Illumina芯片服務平台

Illumina公司以测序业务闻名,而其在生物芯片方面的业务也具有不可忽视的优势和竞争力。 激光共聚焦微珠芯片技术是公司的核心技术之一,也是目前最前沿的芯片技术之一。

自2005年推出第一款芯片之后,Illumina不断创新经济,高通量及可扩展的芯片解决方案以满足日益增长的各种需求。结合了行业领先的芯片技术和infinium方法,我们全面的芯片系列产品提供极高的数据质量和极广的基因组覆盖度,从而加速靶向集合和全基因组研究。上海生工生物有限公司将为广大科研工作者提供基于Illumina Beadlab System的SNP基因分型和拷贝数变异(CNV)检测、DNA甲基化芯片和mRNA表达谱芯片等一系列生物芯片服务解决方案。

Illumina芯片技術特點:

 高重複性、高質量的數據,且單位樣本成本低

 可支持快速、高通量和多重樣本的處理

 提供專家精選、或者定制和半定制的形式

 可快速提供答案

Illumina芯片技術服務平台一览:

 

一、基因組層次研究服務: 

 Illumina human SNP分型芯片服务

芯片名稱

芯片信息

Human omni-1 quad beadchip

此芯片数据来自于人類千人基因组计划测序结果。其中包含了超过114 万个探针信息,可以在一张芯片上平行进行4 个样本的检测。该款芯片包含针对基因SNPs、标签SNPs、拷贝数变化(CNV)及其他高价值的基因组区域设计探针。

Human omni express-12 beachip

含蓋人類基因組計劃HapMap三個階段研究的數據,針對基因SNPs、標簽SNPs、拷貝數變化(CNV)及其他高價值的基因組區域設計探針,共700,000多個位點,每張芯片可同時檢測12個樣本。

Human omni-zhonghua-8 beachip

此芯片是一款專爲中國人設計的全基因組SNP基因分型芯片,每張芯片做8個樣品,芯片覆蓋了在中國人群體中發現的常有和稀有變異,適用于全基因組關聯研究(GWAS)。經優化的90萬個標簽SNP信息來自HapMap所有三個階段及千人基因組計劃(1kGP),並經策略性選擇,可用于在中國人種群中探索全新的疾病和性狀關聯。

Infinium Human Exome BeadChip

此芯片前所未有地覆盖了推定的功能性外显子变异,这些变异精选自12,000多个个体的外显子组和全基因组序列。外显子内容包含了> 240,000个标志物,它们代表了不同群体—包括欧洲、非洲、中国和西班牙个体—以及多种常见病,如II型糖尿病、癌症、代谢及精神疾病。

Cyto SNP-12 BeadChip

此芯片包含30万个和疾病相关的遗传标。数据来源于Hapmap  I和II

Omni2.5-Quad BeadChip

此芯片包含250万个SNP探针及CNV探针。用于基因分型和全基因组CNV分析,平均间隔1.2kb,MAF>2.5%。数据来源于Hapmap  I到III和1000 Genomes。

Omni5-Quad BeadChip

此芯片包含500万个SNP探针及CNV探针。用于基因分型和全基因组CNV分析,平均间隔0.6kb,MAF>1%。数据来源于Hapmap  I到III和1000 Genomes。

 Illumina 动物 SNP分型芯片服务

物種

芯片名稱

芯片信息

Bovine HD BeadChip

Illumina公司與牛類研究專家聯合開發出牛高密度SNP芯片,每個樣本可檢測777962個SNPs。

Ovine SNP50 BeadChip

該芯片由Illumina公司與國際羊基因組協會專家聯合開發,它包含54241個SNP位點。平均每46kb有一個標記,覆蓋整個基因組。

Equine SNP50 BeadChip

该芯片包含54602个SNP位点,这些位点均一分布在15个品种馬匹的全基因组序列上,SNP的平均间隔为43.2kb。

Porcine SNP60 BeadChip

该芯片包含62163个SNP位点,覆盖豬的全基因组。此款芯片整合了多种豬的基因差异,包括杜洛克豬、长白豬,皮特兰豬和大白豬。

Canine HD BeadChip

該芯片包含超過17萬個SNP位點,可以對任何一種家養犬類進行全基因組掃描。

 Illumina 植物 SNP分型芯片服务

物種

芯片名稱

芯片信息

玉米

Maize SNP50 BeadChip

該芯片包含56,110個玉米SNP位點。

甘藍

Intl Brassica SNP Consortium

该芯片包含52,157个甘藍SNP位点。

櫻桃

RosBREED Cherry

该芯片包含5,696个櫻桃SNP位点。

RosBREED Peach

該芯片包含8,144個桃SNP位點。

大豆

BARCSoySNP6k

該芯片包含6,000個大豆SNP位點。

辣椒

UCD TraitGenetics Pepper (Capsicum) Consortium

該芯片包含20,000個辣椒SNP位點。

小麥

Private Wheat90k KSU

该芯片包含81,587个小麥SNP位点。

蘋果

RosBREED Apple

该芯片包含8,788个蘋果SNP位点。

蘋果

Fruitbreedomics Apple20k

该芯片包含20,000 个蘋果SNP位点。

葡萄

GrapeReSeq Consortium

该芯片包含18,071 个葡萄SNP位点。

燕麥

Oat Consortium

该芯片包含4,975 个燕麥SNP位点。

番茄

SolCAP Tomato 2013

該芯片包含7,720個番茄SNP位點。

小麥

US/Australia 9k Wheat Consortium

该芯片包含8,632个小麥SNP位点。

大麥

Barley Consortium 2013

该芯片包含7,864个大麥SNP位点。

馬铃薯

Private WUR-STW Potato Consortium

该芯片包含17,987个馬铃薯SNP位点。

馬铃薯

SolCAP Potato 2013

该芯片包含8,303个馬铃薯SNP位点。

向日葵

KWS-TraitGenetics Private Sunflower

該芯片包含30,000個向日葵SNP位點。

向日葵

Private Sunflower Consortium

該芯片包含10,640個向日葵SNP位點。

棉花

TAMU UCD Cotton Consortium

該芯片包含20,000個棉花SNP位點。

水稻

NSF_McCouch_Rice6k

該芯片包含6,000個水稻SNP位點。

豆類

USDA Common BeanCAP

該芯片包含5,398個SNP位點。

 定制SNP芯片服務:

Illumina提供兩種定制SNP芯片檢測技術:

GoldenGate Custom Panel –低中通量(48~3,072 SNP)

Infinium iSelect HD Custom Genotyping BeadChip-高通量(3,072~1,000,000 SNP)

二、轉錄組層次研究服務: 

 基因表達譜芯片服務

芯片型號

Human HT-12 v4 Expression BeadChip

Mouse WG-6 v2 Expression BeadChip

适应物種

人類

小鼠

産品規格

每張芯片可平行檢測12個樣本

每張芯片可平行檢測6個樣本

芯片介紹

每张芯片含有共约48,000个基因转录本,信息来源除36,000个NCBI RefSeq外,还包含了从UniGene的12,000个转录本信息。

每张芯片包含有约 45,281 个来自 MEMBO-RefSeq 及其补充序列,RIKEN补充序列的转录本信息。

三、表觀遺傳學研究服務

 Illumina DNA甲基化芯片

芯片型號

450K Infinium Methylation Bead Chip

适应物種

人類

産品規格

每張芯片可平行檢測12個樣本

芯片介紹

每个芯片可检测人基因组45万个甲基化位点,覆盖了所有的NCBI注释的基因,包括启动子,3’区和5’区。该芯片所检测的区域主要包括:CpG岛和CpG shores,CpG岛外的CpG位点,人干细胞中已经鉴定的非CpG的甲基化位点,已经鉴定的在不同类型的肿瘤中相对于其正常组织有差异的甲基化位点,编码区外的CpG岛,miRNA启动子区,通过GWAS研究已知的与疾病相关的区域等。

技術支持

電話:021-57072092
Email:service6@sangon.com